Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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