Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M9O19442 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M9O19442 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms