Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sypl1O09117 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms