Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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