Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2888K7N746 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms