Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E030018B13RikJ3QMS9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms