Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HrcG5E8J6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HrcG5E8J6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms