Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610008E11RikG3X964 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610008E11RikG3X964 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms