Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna9G3X8Z7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms