Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Colca2F8VPY8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms