Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm28048F7BCN0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms