Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms