Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Gm10378F6XQQ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Gm10378F6XQQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10378F6XQQ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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