Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21876F6XK35 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms