Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc6F2Z461 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms