Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrdnE9Q9K5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms