Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc141E9Q8Q6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc141E9Q8Q6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms