Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef5E9Q7D5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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Arhgef5E9Q7D5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef5E9Q7D5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms