Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms