Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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