Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BC005561E9Q5E2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms