Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip11E9Q512 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms