Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Acbd4E9Q289 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acbd4E9Q289 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms