Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcc4E9Q236 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms