Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srp54bE9PXC0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp54bE9PXC0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms