Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9008E9PVG0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms