Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde2E9PUP1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms