Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cngb1E1AZ71 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms