Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms