Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms