Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3543D3Z235 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm3543D3Z235 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm3543D3Z235 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3543D3Z235 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm3543D3Z235 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm3543D3Z235 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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