Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc6D3YZP9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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