Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms