Protein–RNA interactions for Protein: D3YV11

Gm5475, Predicted gene 5475, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5475D3YV11 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5475D3YV11 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms