Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms