Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cttnbp2B9EJA2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms