Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdzd8B9EJ80 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdzd8B9EJ80 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd8B9EJ80 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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