Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr3aB2RXC6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms