Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms