Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan5bB2RTN3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms