Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrn3B2RS91 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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