Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.4 ms