Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf25B1AWN9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms