Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik3B1AS29 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms