Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf39A2RT81 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms