Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl41A2AUC9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms