Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtcflA2APF3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms