Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms