Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Frmpd4A2AFR3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frmpd4A2AFR3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms