Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms